Select a Metric:   Select a Category:

Study_RegionSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
turnbaugh_twins_moafts200.0 6.681 1.366 96.964 28.092 57.355 14.317
turnbaugh_twins_moafts360.0 8.110 1.624 118.316 30.464 75.794 19.255
turnbaugh_twins_moafts520.0 8.942 1.846 131.827 35.793 87.764 22.885
turnbaugh_twins_moafts680.0 9.639 1.915 141.694 36.368 97.588 25.245
turnbaugh_twins_moafts840.0 10.171 2.088 152.490 41.731 105.533 28.078
turnbaugh_twins_moafts1000.0 10.628 2.164 159.465 44.742 112.424 29.785
DescriptionSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
The_gut_microbiome_of_obese_and_lean_monozygotic_and_dizygotic_twins200.0 6.681 1.366 96.964 28.092 57.355 14.317
The_gut_microbiome_of_obese_and_lean_monozygotic_and_dizygotic_twins360.0 8.110 1.624 118.316 30.464 75.794 19.255
The_gut_microbiome_of_obese_and_lean_monozygotic_and_dizygotic_twins520.0 8.942 1.846 131.827 35.793 87.764 22.885
The_gut_microbiome_of_obese_and_lean_monozygotic_and_dizygotic_twins680.0 9.639 1.915 141.694 36.368 97.588 25.245
The_gut_microbiome_of_obese_and_lean_monozygotic_and_dizygotic_twins840.0 10.171 2.088 152.490 41.731 105.533 28.078
The_gut_microbiome_of_obese_and_lean_monozygotic_and_dizygotic_twins1000.0 10.628 2.164 159.465 44.742 112.424 29.785
RegionSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
200.0 6.681 1.366 96.964 28.092 57.355 14.317
360.0 8.110 1.624 118.316 30.464 75.794 19.255
520.0 8.942 1.846 131.827 35.793 87.764 22.885
680.0 9.639 1.915 141.694 36.368 97.588 25.245
840.0 10.171 2.088 152.490 41.731 105.533 28.078
1000.0 10.628 2.164 159.465 44.742 112.424 29.785
SampleIDSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
TS1200.0 8.244 nan 139.440 nan 70.400 nan
TS1360.0 10.036 nan 158.453 nan 97.300 nan
TS1520.0 11.353 nan 195.956 nan 117.300 nan
TS1680.0 12.341 nan 209.037 nan 133.700 nan
TS1840.0 13.138 nan 223.487 nan 147.700 nan
TS11000.0 13.695 nan 228.333 nan 159.000 nan
TS2200.0 8.329 nan 141.035 nan 74.300 nan
TS2360.0 10.058 nan 156.211 nan 98.300 nan
TS2520.0 11.265 nan 185.919 nan 114.300 nan
TS2680.0 12.112 nan 209.887 nan 130.500 nan
TS2840.0 12.986 nan 226.617 nan 143.100 nan
TS21000.0 13.730 nan 254.800 nan 154.000 nan
TS3200.0 5.328 nan 84.187 nan 46.700 nan
TS3360.0 6.897 nan 120.108 nan 64.600 nan
TS3520.0 7.570 nan 112.111 nan 72.500 nan
TS3680.0 8.153 nan 134.010 nan 83.000 nan
TS3840.0 8.872 nan 159.438 nan 91.900 nan
TS31000.0 9.290 nan 168.462 nan 99.000 nan
TS4200.0 4.816 nan 60.464 nan 40.500 nan
TS4360.0 5.804 nan 80.700 nan 53.200 nan
TS4520.0 6.240 nan 96.802 nan 62.800 nan
TS4680.0 6.800 nan 109.779 nan 69.800 nan
TS4840.0 7.144 nan 122.322 nan 75.400 nan
TS41000.0 7.466 nan 139.667 nan 81.000 nan
TS5200.0 5.947 nan 79.946 nan 46.700 nan
TS5360.0 7.112 nan 92.131 nan 61.100 nan
TS5520.0 7.954 nan 112.213 nan 70.200 nan
TS5680.0 8.672 nan 145.308 nan 79.100 nan
TS5840.0 9.240 nan 159.595 nan 85.700 nan
TS51000.0 9.767 nan 184.111 nan 93.000 nan
TS6200.0 7.014 nan 100.889 nan 57.000 nan
TS6360.0 8.715 nan 135.808 nan 76.300 nan
TS6520.0 9.638 nan 143.336 nan 87.900 nan
TS6680.0 10.601 nan 158.284 nan 101.000 nan
TS6840.0 11.165 nan 170.682 nan 109.800 nan
TS61000.0 11.993 nan 187.056 nan 119.000 nan
TS7200.0 8.462 nan 122.020 nan 77.500 nan
TS7360.0 10.474 nan 154.773 nan 107.400 nan
TS7520.0 11.204 nan 168.051 nan 122.800 nan
TS7680.0 11.853 nan 172.535 nan 132.700 nan
TS7840.0 12.627 nan 192.464 nan 144.800 nan
TS71000.0 13.027 nan 192.130 nan 151.000 nan
TS8200.0 8.532 nan 123.766 nan 76.200 nan
TS8360.0 10.020 nan 133.481 nan 96.300 nan
TS8520.0 11.097 nan 165.538 nan 113.600 nan
TS8680.0 11.804 nan 163.088 nan 124.100 nan
TS8840.0 12.455 nan 171.949 nan 133.700 nan
TS81000.0 12.955 nan 176.875 nan 141.000 nan
TS9200.0 7.011 nan 97.748 nan 61.800 nan
TS9360.0 8.780 nan 111.326 nan 81.800 nan
TS9520.0 9.872 nan 139.472 nan 95.500 nan
TS9680.0 10.497 nan 144.667 nan 105.300 nan
TS9840.0 10.981 nan 157.352 nan 112.700 nan
TS91000.0 11.617 nan 163.333 nan 120.000 nan
TS13200.0 8.207 nan 136.827 nan 75.700 nan
TS13360.0 10.029 nan 157.130 nan 102.600 nan
TS13520.0 10.868 nan 164.074 nan 116.700 nan
TS13680.0 11.657 nan 198.269 nan 130.900 nan
TS13840.0 12.464 nan 214.781 nan 144.300 nan
TS131000.0 13.069 nan 216.840 nan 153.000 nan
TS14200.0 5.294 nan 89.045 nan 51.600 nan
TS14360.0 6.866 nan 115.596 nan 66.700 nan
TS14520.0 7.398 nan 111.300 nan 76.300 nan
TS14680.0 7.940 nan 124.980 nan 82.200 nan
TS14840.0 8.431 nan 120.504 nan 88.600 nan
TS141000.0 9.268 nan 132.714 nan 95.000 nan
TS15200.0 8.023 nan 120.180 nan 67.500 nan
TS15360.0 10.185 nan 148.033 nan 89.700 nan
TS15520.0 11.671 nan 162.803 nan 105.900 nan
TS15680.0 12.429 nan 164.297 nan 115.300 nan
TS15840.0 13.429 nan 180.085 nan 127.100 nan
TS151000.0 14.072 nan 196.714 nan 136.000 nan
TS19200.0 5.207 nan 64.352 nan 44.900 nan
TS19360.0 6.165 nan 79.838 nan 55.000 nan
TS19520.0 6.808 nan 90.516 nan 66.300 nan
TS19680.0 7.309 nan 91.296 nan 72.000 nan
TS19840.0 7.611 nan 94.898 nan 76.200 nan
TS191000.0 7.807 nan 93.125 nan 80.000 nan
TS20200.0 6.903 nan 84.806 nan 60.300 nan
TS20360.0 8.365 nan 108.657 nan 80.200 nan
TS20520.0 9.026 nan 121.270 nan 90.400 nan
TS20680.0 9.454 nan 126.502 nan 96.900 nan
TS20840.0 9.877 nan 133.271 nan 103.100 nan
TS201000.0 10.180 nan 142.214 nan 109.000 nan
TS21200.0 7.651 nan 120.419 nan 73.200 nan
TS21360.0 8.962 nan 131.848 nan 90.100 nan
TS21520.0 9.528 nan 137.668 nan 101.400 nan
TS21680.0 10.178 nan 138.941 nan 109.400 nan
TS21840.0 10.625 nan 146.743 nan 117.100 nan
TS211000.0 11.006 nan 147.800 nan 123.000 nan
TS25200.0 8.213 nan 133.931 nan 72.400 nan
TS25360.0 9.869 nan 153.016 nan 96.000 nan
TS25520.0 11.284 nan 169.771 nan 115.400 nan
TS25680.0 12.042 nan 174.327 nan 126.000 nan
TS25840.0 12.821 nan 190.152 nan 137.400 nan
TS251000.0 13.459 nan 196.038 nan 147.000 nan
TS26200.0 8.348 nan 121.432 nan 71.100 nan
TS26360.0 9.887 nan 156.583 nan 92.500 nan
TS26520.0 10.886 nan 175.586 nan 109.400 nan
TS26680.0 11.745 nan 180.357 nan 122.900 nan
TS26840.0 12.442 nan 195.541 nan 133.400 nan
TS261000.0 12.811 nan 183.241 nan 141.000 nan
TS27200.0 7.147 nan 128.979 nan 62.400 nan
TS27360.0 8.760 nan 140.559 nan 84.800 nan
TS27520.0 9.774 nan 170.917 nan 100.800 nan
TS27680.0 10.341 nan 168.851 nan 112.600 nan
TS27840.0 10.908 nan 173.746 nan 122.800 nan
TS271000.0 11.399 nan 182.111 nan 133.000 nan
TS28200.0 6.250 nan 90.864 nan 57.300 nan
TS28360.0 7.703 nan 126.428 nan 76.400 nan
TS28520.0 8.386 nan 135.521 nan 86.600 nan
TS28680.0 9.040 nan 139.669 nan 98.200 nan
TS28840.0 9.396 nan 149.211 nan 103.900 nan
TS281000.0 9.755 nan 155.333 nan 112.000 nan
TS29200.0 4.684 nan 75.234 nan 41.300 nan
TS29360.0 5.894 nan 83.064 nan 55.100 nan
TS29520.0 6.674 nan 95.982 nan 63.200 nan
TS29680.0 7.229 nan 100.526 nan 69.900 nan
TS29840.0 7.915 nan 131.951 nan 77.800 nan
TS291000.0 8.191 nan 119.750 nan 81.000 nan
TS30200.0 7.886 nan 112.207 nan 67.300 nan
TS30360.0 9.373 nan 132.658 nan 90.500 nan
TS30520.0 10.051 nan 138.455 nan 102.900 nan
TS30680.0 11.005 nan 153.341 nan 116.300 nan
TS30840.0 11.579 nan 155.136 nan 124.600 nan
TS301000.0 11.913 nan 160.292 nan 131.000 nan
TS31200.0 6.709 nan 81.599 nan 51.200 nan
TS31360.0 7.969 nan 96.971 nan 66.900 nan
TS31520.0 8.643 nan 102.651 nan 74.900 nan
TS31680.0 9.224 nan 109.320 nan 82.100 nan
TS31840.0 9.716 nan 119.817 nan 88.800 nan
TS311000.0 9.981 nan 125.231 nan 94.000 nan
TS32200.0 6.542 nan 84.288 nan 51.500 nan
TS32360.0 8.024 nan 119.521 nan 70.200 nan
TS32520.0 8.592 nan 142.816 nan 81.200 nan
TS32680.0 9.295 nan 144.043 nan 91.000 nan
TS32840.0 9.485 nan 152.348 nan 96.900 nan
TS321000.0 9.898 nan 152.750 nan 104.000 nan
TS33200.0 8.595 nan 130.221 nan 74.700 nan
TS33360.0 9.924 nan 145.446 nan 95.400 nan
TS33520.0 11.107 nan 163.134 nan 111.800 nan
TS33680.0 11.846 nan 174.290 nan 122.700 nan
TS33840.0 12.568 nan 197.936 nan 134.800 nan
TS331000.0 12.981 nan 201.333 nan 143.000 nan
TS49200.0 5.992 nan 75.710 nan 45.600 nan
TS49360.0 7.172 nan 85.978 nan 58.800 nan
TS49520.0 7.903 nan 87.056 nan 66.900 nan
TS49680.0 8.397 nan 105.536 nan 76.900 nan
TS49840.0 8.740 nan 116.066 nan 80.100 nan
TS491000.0 9.110 nan 122.909 nan 86.000 nan
TS50200.0 4.313 nan 47.141 nan 32.600 nan
TS50360.0 5.075 nan 59.265 nan 40.000 nan
TS50520.0 5.277 nan 58.465 nan 43.800 nan
TS50680.0 6.193 nan 68.469 nan 51.100 nan
TS50840.0 6.115 nan 67.594 nan 51.800 nan
TS501000.0 6.591 nan 71.111 nan 56.000 nan
TS51200.0 4.632 nan 48.174 nan 29.800 nan
TS51360.0 5.846 nan 83.497 nan 44.300 nan
TS51520.0 6.452 nan 105.686 nan 51.600 nan
TS51680.0 7.051 nan 120.385 nan 58.700 nan
TS51840.0 7.752 nan 127.121 nan 66.000 nan
TS511000.0 8.124 nan 132.545 nan 72.000 nan
TS55200.0 5.656 nan 77.845 nan 49.500 nan
TS55360.0 6.640 nan 87.971 nan 63.000 nan
TS55520.0 7.036 nan 87.043 nan 68.900 nan
TS55680.0 7.615 nan 103.846 nan 76.200 nan
TS55840.0 7.734 nan 96.008 nan 79.300 nan
TS551000.0 8.021 nan 103.250 nan 84.000 nan
TS56200.0 5.772 nan 82.878 nan 51.900 nan
TS56360.0 7.092 nan 93.058 nan 69.200 nan
TS56520.0 7.904 nan 106.856 nan 81.700 nan
TS56680.0 8.414 nan 109.903 nan 87.300 nan
TS56840.0 8.902 nan 114.732 nan 94.100 nan
TS561000.0 9.215 nan 118.312 nan 98.000 nan
TS57200.0 4.283 nan 39.013 nan 24.200 nan
TS57360.0 4.874 nan 50.700 nan 29.500 nan
TS57520.0 5.441 nan 55.569 nan 34.800 nan
TS57680.0 6.150 nan 63.425 nan 39.500 nan
TS57840.0 6.253 nan 53.854 nan 41.600 nan
TS571000.0 6.557 nan 52.273 nan 44.000 nan
TS148200.0 7.827 nan 111.806 nan 71.000 nan
TS148360.0 9.362 nan 157.927 nan 94.600 nan
TS148520.0 10.330 nan 168.822 nan 110.000 nan
TS148680.0 11.215 nan 178.799 nan 124.300 nan
TS148840.0 11.691 nan 198.279 nan 134.500 nan
TS1481000.0 12.113 nan 218.250 nan 144.000 nan
TS149200.0 6.781 nan 112.567 nan 63.200 nan
TS149360.0 8.237 nan 127.711 nan 84.800 nan
TS149520.0 9.357 nan 148.104 nan 100.200 nan
TS149680.0 10.188 nan 161.865 nan 113.400 nan
TS149840.0 10.711 nan 183.769 nan 120.900 nan
TS1491000.0 11.139 nan 201.929 nan 128.000 nan
TS150200.0 5.890 nan 80.802 nan 51.400 nan
TS150360.0 7.463 nan 119.999 nan 68.600 nan
TS150520.0 8.502 nan 130.841 nan 78.200 nan
TS150680.0 9.315 nan 128.077 nan 85.400 nan
TS150840.0 9.858 nan 134.714 nan 92.700 nan
TS1501000.0 10.524 nan 141.500 nan 99.000 nan
DietSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
200.0 6.681 1.366 96.964 28.092 57.355 14.317
360.0 8.110 1.624 118.316 30.464 75.794 19.255
520.0 8.942 1.846 131.827 35.793 87.764 22.885
680.0 9.639 1.915 141.694 36.368 97.588 25.245
840.0 10.171 2.088 152.490 41.731 105.533 28.078
1000.0 10.628 2.164 159.465 44.742 112.424 29.785
hostSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
human200.0 6.681 1.366 96.964 28.092 57.355 14.317
human360.0 8.110 1.624 118.316 30.464 75.794 19.255
human520.0 8.942 1.846 131.827 35.793 87.764 22.885
human680.0 9.639 1.915 141.694 36.368 97.588 25.245
human840.0 10.171 2.088 152.490 41.731 105.533 28.078
human1000.0 10.628 2.164 159.465 44.742 112.424 29.785
REF_BarcodeSequenceSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
200.0 6.681 1.366 96.964 28.092 57.355 14.317
360.0 8.110 1.624 118.316 30.464 75.794 19.255
520.0 8.942 1.846 131.827 35.793 87.764 22.885
680.0 9.639 1.915 141.694 36.368 97.588 25.245
840.0 10.171 2.088 152.490 41.731 105.533 28.078
1000.0 10.628 2.164 159.465 44.742 112.424 29.785
common_nameSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
TS1200.0 8.244 nan 139.440 nan 70.400 nan
TS1360.0 10.036 nan 158.453 nan 97.300 nan
TS1520.0 11.353 nan 195.956 nan 117.300 nan
TS1680.0 12.341 nan 209.037 nan 133.700 nan
TS1840.0 13.138 nan 223.487 nan 147.700 nan
TS11000.0 13.695 nan 228.333 nan 159.000 nan
TS2200.0 8.329 nan 141.035 nan 74.300 nan
TS2360.0 10.058 nan 156.211 nan 98.300 nan
TS2520.0 11.265 nan 185.919 nan 114.300 nan
TS2680.0 12.112 nan 209.887 nan 130.500 nan
TS2840.0 12.986 nan 226.617 nan 143.100 nan
TS21000.0 13.730 nan 254.800 nan 154.000 nan
TS3200.0 5.328 nan 84.187 nan 46.700 nan
TS3360.0 6.897 nan 120.108 nan 64.600 nan
TS3520.0 7.570 nan 112.111 nan 72.500 nan
TS3680.0 8.153 nan 134.010 nan 83.000 nan
TS3840.0 8.872 nan 159.438 nan 91.900 nan
TS31000.0 9.290 nan 168.462 nan 99.000 nan
TS4200.0 4.816 nan 60.464 nan 40.500 nan
TS4360.0 5.804 nan 80.700 nan 53.200 nan
TS4520.0 6.240 nan 96.802 nan 62.800 nan
TS4680.0 6.800 nan 109.779 nan 69.800 nan
TS4840.0 7.144 nan 122.322 nan 75.400 nan
TS41000.0 7.466 nan 139.667 nan 81.000 nan
TS5200.0 5.947 nan 79.946 nan 46.700 nan
TS5360.0 7.112 nan 92.131 nan 61.100 nan
TS5520.0 7.954 nan 112.213 nan 70.200 nan
TS5680.0 8.672 nan 145.308 nan 79.100 nan
TS5840.0 9.240 nan 159.595 nan 85.700 nan
TS51000.0 9.767 nan 184.111 nan 93.000 nan
TS6200.0 7.014 nan 100.889 nan 57.000 nan
TS6360.0 8.715 nan 135.808 nan 76.300 nan
TS6520.0 9.638 nan 143.336 nan 87.900 nan
TS6680.0 10.601 nan 158.284 nan 101.000 nan
TS6840.0 11.165 nan 170.682 nan 109.800 nan
TS61000.0 11.993 nan 187.056 nan 119.000 nan
TS7200.0 8.462 nan 122.020 nan 77.500 nan
TS7360.0 10.474 nan 154.773 nan 107.400 nan
TS7520.0 11.204 nan 168.051 nan 122.800 nan
TS7680.0 11.853 nan 172.535 nan 132.700 nan
TS7840.0 12.627 nan 192.464 nan 144.800 nan
TS71000.0 13.027 nan 192.130 nan 151.000 nan
TS8200.0 8.532 nan 123.766 nan 76.200 nan
TS8360.0 10.020 nan 133.481 nan 96.300 nan
TS8520.0 11.097 nan 165.538 nan 113.600 nan
TS8680.0 11.804 nan 163.088 nan 124.100 nan
TS8840.0 12.455 nan 171.949 nan 133.700 nan
TS81000.0 12.955 nan 176.875 nan 141.000 nan
TS9200.0 7.011 nan 97.748 nan 61.800 nan
TS9360.0 8.780 nan 111.326 nan 81.800 nan
TS9520.0 9.872 nan 139.472 nan 95.500 nan
TS9680.0 10.497 nan 144.667 nan 105.300 nan
TS9840.0 10.981 nan 157.352 nan 112.700 nan
TS91000.0 11.617 nan 163.333 nan 120.000 nan
TS13200.0 8.207 nan 136.827 nan 75.700 nan
TS13360.0 10.029 nan 157.130 nan 102.600 nan
TS13520.0 10.868 nan 164.074 nan 116.700 nan
TS13680.0 11.657 nan 198.269 nan 130.900 nan
TS13840.0 12.464 nan 214.781 nan 144.300 nan
TS131000.0 13.069 nan 216.840 nan 153.000 nan
TS14200.0 5.294 nan 89.045 nan 51.600 nan
TS14360.0 6.866 nan 115.596 nan 66.700 nan
TS14520.0 7.398 nan 111.300 nan 76.300 nan
TS14680.0 7.940 nan 124.980 nan 82.200 nan
TS14840.0 8.431 nan 120.504 nan 88.600 nan
TS141000.0 9.268 nan 132.714 nan 95.000 nan
TS15200.0 8.023 nan 120.180 nan 67.500 nan
TS15360.0 10.185 nan 148.033 nan 89.700 nan
TS15520.0 11.671 nan 162.803 nan 105.900 nan
TS15680.0 12.429 nan 164.297 nan 115.300 nan
TS15840.0 13.429 nan 180.085 nan 127.100 nan
TS151000.0 14.072 nan 196.714 nan 136.000 nan
TS19200.0 5.207 nan 64.352 nan 44.900 nan
TS19360.0 6.165 nan 79.838 nan 55.000 nan
TS19520.0 6.808 nan 90.516 nan 66.300 nan
TS19680.0 7.309 nan 91.296 nan 72.000 nan
TS19840.0 7.611 nan 94.898 nan 76.200 nan
TS191000.0 7.807 nan 93.125 nan 80.000 nan
TS20200.0 6.903 nan 84.806 nan 60.300 nan
TS20360.0 8.365 nan 108.657 nan 80.200 nan
TS20520.0 9.026 nan 121.270 nan 90.400 nan
TS20680.0 9.454 nan 126.502 nan 96.900 nan
TS20840.0 9.877 nan 133.271 nan 103.100 nan
TS201000.0 10.180 nan 142.214 nan 109.000 nan
TS21200.0 7.651 nan 120.419 nan 73.200 nan
TS21360.0 8.962 nan 131.848 nan 90.100 nan
TS21520.0 9.528 nan 137.668 nan 101.400 nan
TS21680.0 10.178 nan 138.941 nan 109.400 nan
TS21840.0 10.625 nan 146.743 nan 117.100 nan
TS211000.0 11.006 nan 147.800 nan 123.000 nan
TS25200.0 8.213 nan 133.931 nan 72.400 nan
TS25360.0 9.869 nan 153.016 nan 96.000 nan
TS25520.0 11.284 nan 169.771 nan 115.400 nan
TS25680.0 12.042 nan 174.327 nan 126.000 nan
TS25840.0 12.821 nan 190.152 nan 137.400 nan
TS251000.0 13.459 nan 196.038 nan 147.000 nan
TS26200.0 8.348 nan 121.432 nan 71.100 nan
TS26360.0 9.887 nan 156.583 nan 92.500 nan
TS26520.0 10.886 nan 175.586 nan 109.400 nan
TS26680.0 11.745 nan 180.357 nan 122.900 nan
TS26840.0 12.442 nan 195.541 nan 133.400 nan
TS261000.0 12.811 nan 183.241 nan 141.000 nan
TS27200.0 7.147 nan 128.979 nan 62.400 nan
TS27360.0 8.760 nan 140.559 nan 84.800 nan
TS27520.0 9.774 nan 170.917 nan 100.800 nan
TS27680.0 10.341 nan 168.851 nan 112.600 nan
TS27840.0 10.908 nan 173.746 nan 122.800 nan
TS271000.0 11.399 nan 182.111 nan 133.000 nan
TS28200.0 6.250 nan 90.864 nan 57.300 nan
TS28360.0 7.703 nan 126.428 nan 76.400 nan
TS28520.0 8.386 nan 135.521 nan 86.600 nan
TS28680.0 9.040 nan 139.669 nan 98.200 nan
TS28840.0 9.396 nan 149.211 nan 103.900 nan
TS281000.0 9.755 nan 155.333 nan 112.000 nan
TS29200.0 4.684 nan 75.234 nan 41.300 nan
TS29360.0 5.894 nan 83.064 nan 55.100 nan
TS29520.0 6.674 nan 95.982 nan 63.200 nan
TS29680.0 7.229 nan 100.526 nan 69.900 nan
TS29840.0 7.915 nan 131.951 nan 77.800 nan
TS291000.0 8.191 nan 119.750 nan 81.000 nan
TS30200.0 7.886 nan 112.207 nan 67.300 nan
TS30360.0 9.373 nan 132.658 nan 90.500 nan
TS30520.0 10.051 nan 138.455 nan 102.900 nan
TS30680.0 11.005 nan 153.341 nan 116.300 nan
TS30840.0 11.579 nan 155.136 nan 124.600 nan
TS301000.0 11.913 nan 160.292 nan 131.000 nan
TS31200.0 6.709 nan 81.599 nan 51.200 nan
TS31360.0 7.969 nan 96.971 nan 66.900 nan
TS31520.0 8.643 nan 102.651 nan 74.900 nan
TS31680.0 9.224 nan 109.320 nan 82.100 nan
TS31840.0 9.716 nan 119.817 nan 88.800 nan
TS311000.0 9.981 nan 125.231 nan 94.000 nan
TS32200.0 6.542 nan 84.288 nan 51.500 nan
TS32360.0 8.024 nan 119.521 nan 70.200 nan
TS32520.0 8.592 nan 142.816 nan 81.200 nan
TS32680.0 9.295 nan 144.043 nan 91.000 nan
TS32840.0 9.485 nan 152.348 nan 96.900 nan
TS321000.0 9.898 nan 152.750 nan 104.000 nan
TS33200.0 8.595 nan 130.221 nan 74.700 nan
TS33360.0 9.924 nan 145.446 nan 95.400 nan
TS33520.0 11.107 nan 163.134 nan 111.800 nan
TS33680.0 11.846 nan 174.290 nan 122.700 nan
TS33840.0 12.568 nan 197.936 nan 134.800 nan
TS331000.0 12.981 nan 201.333 nan 143.000 nan
TS49200.0 5.992 nan 75.710 nan 45.600 nan
TS49360.0 7.172 nan 85.978 nan 58.800 nan
TS49520.0 7.903 nan 87.056 nan 66.900 nan
TS49680.0 8.397 nan 105.536 nan 76.900 nan
TS49840.0 8.740 nan 116.066 nan 80.100 nan
TS491000.0 9.110 nan 122.909 nan 86.000 nan
TS50200.0 4.313 nan 47.141 nan 32.600 nan
TS50360.0 5.075 nan 59.265 nan 40.000 nan
TS50520.0 5.277 nan 58.465 nan 43.800 nan
TS50680.0 6.193 nan 68.469 nan 51.100 nan
TS50840.0 6.115 nan 67.594 nan 51.800 nan
TS501000.0 6.591 nan 71.111 nan 56.000 nan
TS51200.0 4.632 nan 48.174 nan 29.800 nan
TS51360.0 5.846 nan 83.497 nan 44.300 nan
TS51520.0 6.452 nan 105.686 nan 51.600 nan
TS51680.0 7.051 nan 120.385 nan 58.700 nan
TS51840.0 7.752 nan 127.121 nan 66.000 nan
TS511000.0 8.124 nan 132.545 nan 72.000 nan
TS55200.0 5.656 nan 77.845 nan 49.500 nan
TS55360.0 6.640 nan 87.971 nan 63.000 nan
TS55520.0 7.036 nan 87.043 nan 68.900 nan
TS55680.0 7.615 nan 103.846 nan 76.200 nan
TS55840.0 7.734 nan 96.008 nan 79.300 nan
TS551000.0 8.021 nan 103.250 nan 84.000 nan
TS56200.0 5.772 nan 82.878 nan 51.900 nan
TS56360.0 7.092 nan 93.058 nan 69.200 nan
TS56520.0 7.904 nan 106.856 nan 81.700 nan
TS56680.0 8.414 nan 109.903 nan 87.300 nan
TS56840.0 8.902 nan 114.732 nan 94.100 nan
TS561000.0 9.215 nan 118.312 nan 98.000 nan
TS57200.0 4.283 nan 39.013 nan 24.200 nan
TS57360.0 4.874 nan 50.700 nan 29.500 nan
TS57520.0 5.441 nan 55.569 nan 34.800 nan
TS57680.0 6.150 nan 63.425 nan 39.500 nan
TS57840.0 6.253 nan 53.854 nan 41.600 nan
TS571000.0 6.557 nan 52.273 nan 44.000 nan
TS148200.0 7.827 nan 111.806 nan 71.000 nan
TS148360.0 9.362 nan 157.927 nan 94.600 nan
TS148520.0 10.330 nan 168.822 nan 110.000 nan
TS148680.0 11.215 nan 178.799 nan 124.300 nan
TS148840.0 11.691 nan 198.279 nan 134.500 nan
TS1481000.0 12.113 nan 218.250 nan 144.000 nan
TS149200.0 6.781 nan 112.567 nan 63.200 nan
TS149360.0 8.237 nan 127.711 nan 84.800 nan
TS149520.0 9.357 nan 148.104 nan 100.200 nan
TS149680.0 10.188 nan 161.865 nan 113.400 nan
TS149840.0 10.711 nan 183.769 nan 120.900 nan
TS1491000.0 11.139 nan 201.929 nan 128.000 nan
TS150200.0 5.890 nan 80.802 nan 51.400 nan
TS150360.0 7.463 nan 119.999 nan 68.600 nan
TS150520.0 8.502 nan 130.841 nan 78.200 nan
TS150680.0 9.315 nan 128.077 nan 85.400 nan
TS150840.0 9.858 nan 134.714 nan 92.700 nan
TS1501000.0 10.524 nan 141.500 nan 99.000 nan
REF_LinkerPrimerSequenceSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
CATGCTGCCTCCCGTAGGAGT200.0 6.681 1.366 96.964 28.092 57.355 14.317
CATGCTGCCTCCCGTAGGAGT360.0 8.110 1.624 118.316 30.464 75.794 19.255
CATGCTGCCTCCCGTAGGAGT520.0 8.942 1.846 131.827 35.793 87.764 22.885
CATGCTGCCTCCCGTAGGAGT680.0 9.639 1.915 141.694 36.368 97.588 25.245
CATGCTGCCTCCCGTAGGAGT840.0 10.171 2.088 152.490 41.731 105.533 28.078
CATGCTGCCTCCCGTAGGAGT1000.0 10.628 2.164 159.465 44.742 112.424 29.785
StudySeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
turnbaugh_twins_moafts200.0 6.681 1.366 96.964 28.092 57.355 14.317
turnbaugh_twins_moafts360.0 8.110 1.624 118.316 30.464 75.794 19.255
turnbaugh_twins_moafts520.0 8.942 1.846 131.827 35.793 87.764 22.885
turnbaugh_twins_moafts680.0 9.639 1.915 141.694 36.368 97.588 25.245
turnbaugh_twins_moafts840.0 10.171 2.088 152.490 41.731 105.533 28.078
turnbaugh_twins_moafts1000.0 10.628 2.164 159.465 44.742 112.424 29.785
host_regionSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
human200.0 6.681 1.366 96.964 28.092 57.355 14.317
human360.0 8.110 1.624 118.316 30.464 75.794 19.255
human520.0 8.942 1.846 131.827 35.793 87.764 22.885
human680.0 9.639 1.915 141.694 36.368 97.588 25.245
human840.0 10.171 2.088 152.490 41.731 105.533 28.078
human1000.0 10.628 2.164 159.465 44.742 112.424 29.785
Lean_ObeseSeqs/Sample PD_whole_tree Ave.PD_whole_tree Err. chao1 Ave.chao1 Err. observed_species Ave.observed_species Err.
lean200.0 7.304 1.308 109.483 27.153 63.258 13.086
lean360.0 8.846 1.529 131.214 27.913 84.042 18.022
lean520.0 9.732 1.764 149.223 33.235 97.908 21.559
lean680.0 10.457 1.858 161.744 34.028 108.750 24.186
lean840.0 11.079 2.026 174.131 37.744 118.317 27.082
lean1000.0 11.594 2.067 181.894 37.960 126.083 28.433
obese200.0 6.000 1.121 83.843 25.640 50.975 13.702
obese360.0 7.270 1.370 104.519 29.955 66.919 18.209
obese520.0 8.002 1.528 115.228 34.051 77.044 21.219
obese680.0 8.668 1.562 122.773 33.000 85.800 23.354
obese840.0 9.078 1.676 130.790 38.982 91.981 25.487
obese1000.0 9.483 1.754 136.842 44.234 98.000 27.311
overweight200.0 7.369 1.139 108.909 16.297 63.600 9.391
overweight360.0 9.032 1.171 131.514 14.184 84.400 10.818
overweight520.0 10.054 1.409 143.195 18.892 97.720 13.660
overweight680.0 10.786 1.476 154.121 14.176 108.520 13.923
overweight840.0 11.486 1.552 169.989 16.581 118.220 14.951
overweight1000.0 11.975 1.597 178.027 17.403 125.800 15.354